地球連合とザフト軍による闘いの終結から約２年後の世界。 先の戦争で両親と妹を失った少年シン・アスカは心に深い傷を負いながらも、自らインパルスガンダムのパイロットとなり、戦いに身を投じていく。登場人物それぞれが背負う“運命”、そしてすれ違う想い…。加速していく世界の思惑の中で、少年たちに訪れる過酷な未来とは？
